Location: A review of cardiac cellular electrophysiology models @ ae7a0b93f4ee / tutorial / csim-reference-description / named_2112.xml

Author:
David Nickerson <david.nickerson@gmail.com>
Date:
2021-09-16 01:20:40+12:00
Desc:
Upadte jupyter notebook with MNT and DFN comparison figure
Permanent Source URI:
https://models.fieldml.org/workspace/a1/rawfile/ae7a0b93f4ee5fda3d81ba97eb459f958b2819c9/tutorial/csim-reference-description/named_2112.xml

<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en"><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2491','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">fCa_infinity</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2492','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">alpha_fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2493','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">beta_fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2494','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">gamma_fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.23</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.46</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2492','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">alpha_fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2305','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">Cai</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.000325</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mM</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>8.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2493','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">beta_fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.1</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2305','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">Cai</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.0005</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mM</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.0001</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mM</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2494','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">gamma_fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.2</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2305','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">Cai</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.00075</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mM</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.0008</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mM</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mfrac><mml:mrow><mml:mo>d</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2298','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>d</mml:mo><mml:mi><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2123','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">time</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mi></mml:mrow></mml:mfrac><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>{</mml:mo><mml:mtable><mml:mtr><mml:mtd><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mtd><mml:mtd><mml:mtext>&#xA0; if &#xA0;</mml:mtext></mml:mtd><mml:mtd><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2491','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">fCa_infinity</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&gt;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2298','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>&#x2227;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&gt;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-60.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mtd></mml:mtr><mml:mtr><mml:mtd><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2491','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">fCa_infinity</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2298','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2498','named_2112');"><mml:mi mathvariant="normal">tau_fCa</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mtd><mml:mtd><mml:mtext>&#xA0; otherwise &#xA0;</mml:mtext></mml:mtd></mml:mtr></mml:mtable></mml:mrow></mml:mrow></math></html>