Location: A review of cardiac cellular electrophysiology models @ ae7a0b93f4ee / tutorial / csim-reference-description / named_2103.xml

Author:
David Nickerson <david.nickerson@gmail.com>
Date:
2021-09-16 01:20:40+12:00
Desc:
Upadte jupyter notebook with MNT and DFN comparison figure
Permanent Source URI:
https://models.fieldml.org/workspace/a1/rawfile/ae7a0b93f4ee5fda3d81ba97eb459f958b2819c9/tutorial/csim-reference-description/named_2103.xml

<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en"><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2442','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">j_infinity</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:msup><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>71.55</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>7.43</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>2.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2444','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">alpha_j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>{</mml:mo><mml:mtable><mml:mtr><mml:mtd><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-2.5428E4</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV_per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.2444</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>6.948E-6</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV_per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-0.04391</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>37.78</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.311</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>79.23</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mtd><mml:mtd><mml:mtext>&#xA0; if &#xA0;</mml:mtext></mml:mtd><mml:mtd><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&lt;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-40.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mtd></mml:mtr><mml:mtr><mml:mtd><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mtd><mml:mtd><mml:mtext>&#xA0; otherwise &#xA0;</mml:mtext></mml:mtd></mml:mtr></mml:mtable></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2445','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">beta_j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>{</mml:mo><mml:mtable><mml:mtr><mml:mtd><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.02424</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-0.01052</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-0.1378</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>40.14</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mtd><mml:mtd><mml:mtext>&#xA0; if &#xA0;</mml:mtext></mml:mtd><mml:mtd><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&lt;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-40.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mtd></mml:mtr><mml:mtr><mml:mtd><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.6</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_ms</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>0.057</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:msup><mml:mi>e</mml:mi><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>-0.1</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">per_mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo rspace="thinmathspace">&#x2062;</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>(</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2133','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">V</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>32.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">mV</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>)</mml:mo></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:msup></mml:mrow></mml:mrow></mml:mtd><mml:mtd><mml:mtext>&#xA0; otherwise &#xA0;</mml:mtext></mml:mtd></mml:mtr></mml:mtable></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2446','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">tau_j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>[</mml:mo><mml:mn>1.0</mml:mn><mml:mo rspace="thinmathspace"/><xhtml:a class="cellml-units-name" href="javascript:;" onclick="alert('Not implemented yet');"><mml:mi mathvariant="italic" mathsize="small">dimensionless</mml:mi></xhtml:a><mml:mo>]</mml:mo></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2444','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">alpha_j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>+</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2445','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">beta_j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math><math mode="display" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:mrow xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xhtml="http://www.w3.org/1999/xhtml"><mml:mfrac><mml:mrow><mml:mo>d</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2222','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mrow><mml:mo>d</mml:mo><mml:mi><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2123','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">time</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mi></mml:mrow></mml:mfrac><mml:mo>=</mml:mo><mml:mrow><mml:mrow><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2442','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">j_infinity</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow><mml:mo>&#x2212;</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2222','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow><mml:mo>/</mml:mo><mml:mrow><xhtml:a class="cellml-variable-name" href="javascript:;" onclick="top.displayContentItem('named_2446','named_2103');"><mml:mi mathvariant="normal">tau_j</mml:mi></xhtml:a></mml:mrow></mml:mrow></mml:mrow></math></html>